長江是中國第一長河，具有豐富的水生生物資源，是世界著名的生物多樣性熱點地區(qū)，保護和研究價值極高。長江中游是青魚（Mylopharyngodon piceus）、草魚（Ctenopharyngodon idellus）、鰱 （Hypophthalmichthys molitrix）、鳙（Aristichthys nobilis）等經(jīng)濟魚類和中華鱘（Acipenser sinensis）等珍稀瀕危動物的主要繁殖和棲息地之一。但自 20 世紀 80 年代以來，長江水生生物資源量持續(xù)降低，在長江“十年禁漁”的背景下，如何整合新的方法和技術(shù)監(jiān)測長江中游魚類多樣性，評估禁漁效果，提出合適的保護方案是當前長江中游魚類保護亟待解決的關(guān)鍵問題。本研究構(gòu)建了長江中游魚類eDNA宏條形碼參考數(shù)據(jù)庫，優(yōu)化eDNA監(jiān)測數(shù)據(jù)分析中技術(shù)參數(shù)的設(shè)置，檢驗魚類eDNA監(jiān)測的時空特征，并基于環(huán)境DNA技術(shù)對長江中游干流的魚類空間分布進行研究，探討eDNA宏條形碼技術(shù)在監(jiān)測魚類多樣性方面的有效度，并為魚類多樣性調(diào)查方法提供有效的輔助方法。