根據(jù)《農(nóng)業(yè)部關(guān)于發(fā)布第五輪農(nóng)業(yè)部重點開放實驗室建設(shè)名單的通知》（農(nóng)科教[2008]3號），長江水產(chǎn)研究所申報的農(nóng)業(yè)部淡水生物多樣性保護與利用重點開放實驗室被列入第五輪農(nóng)業(yè)部重點開放實驗室名單，同時第四輪命名的農(nóng)業(yè)部淡水魚類種質(zhì)資源與生物技術(shù)重點開放實驗室相應取消。

        農(nóng)業(yè)部淡水生物多樣性保護與利用重點開放實驗室將從遺傳、物種和生態(tài)系統(tǒng)三個層面開展我國淡水生物多樣性基礎(chǔ)調(diào)查及其動態(tài)監(jiān)測，甄別淡水生物多樣性脅迫要素，認識物種瀕危機理，為我國淡水生物多樣性保護、管理和利用提供理論依據(jù)；研究和挖掘淡水魚類種質(zhì)資源，培育優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)、抗逆的淡水魚類新品種；研究淡水生物收集、整理、保存及其多樣性管理技術(shù)，開發(fā)淡水生物特別是淡水魚類健康養(yǎng)殖新技術(shù)。實驗室將在原農(nóng)業(yè)部淡水魚類種質(zhì)資源與生物技術(shù)實驗室的基礎(chǔ)上建設(shè)，以長江所的優(yōu)勢學科和人員為主（約占實驗室2/3），聯(lián)合華中農(nóng)業(yè)大學淡水水產(chǎn)增養(yǎng)殖生物學重點實驗室的優(yōu)勢學科和人員（約占實驗室的1/3）。組建后將成立5個研究室：1.遺傳多樣性與種質(zhì)資源改良研究室，主要開展分子遺傳多樣性、重要基因的克隆與表達、新品種選育及種質(zhì)資源的保存等方面的研究；2.物種多樣性保護與保存研究室，包括物種多樣性現(xiàn)狀與編目、種群定量評估與行為生態(tài)學、珍稀物種的瀕危機制及珍稀瀕危動物的保護技術(shù)等方面的研究；3. 人類活動與淡水生態(tài)系統(tǒng)多樣性研究室，開展淡水生態(tài)系統(tǒng)多樣性格局與退化機制、水工程生態(tài)效應、水環(huán)境污染生態(tài)效應及漁業(yè)活動與水生態(tài)安全等方面的研究；4.淡水生物多樣性管理研究室，主要研究退化生態(tài)系統(tǒng)的恢復與重建、水域自然保護區(qū)的建設(shè)與管理、外來物種入侵的生態(tài)學效應與管理及轉(zhuǎn)基因水產(chǎn)動物的生物安全評價；5.淡水魚類健康養(yǎng)殖研究室，研究內(nèi)容包括淡水養(yǎng)殖基礎(chǔ)生物學、水生動物營養(yǎng)與飼料、水生動物疫病的診斷與防控、淡水池塘生物與生態(tài)工程及水產(chǎn)品質(zhì)量安全與標準等。

        本輪重點開放實驗室的評估命名工作是2007年組織開展的，主要是為加強農(nóng)業(yè)研究基地建設(shè)，提升農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新能力，為現(xiàn)代農(nóng)業(yè)和社會主義新農(nóng)村建設(shè)提供強有力的科技支撐。農(nóng)業(yè)部重點開放實驗室作為農(nóng)業(yè)部重要的農(nóng)業(yè)研究基地，在今后的建設(shè)和運行中，將有計劃地承擔相關(guān)重大技術(shù)和重點領(lǐng)域的研發(fā)任務。