以長江流域主要養殖種類（如鰱、鳙、鯽、黃鱔和克氏原螯蝦等）為研究對象，研究特異種質和核心種質的表型和基因型特點，重點開展品質（肌間刺、脂肪含量等）、抗病、抗逆、飼料轉化率等性狀的精準測量和鑒定，并開展全基因組水平的基因型鑒定，建立核心種質的表型和基因型數據庫；全面掌握其性狀特征、種群遺傳多樣性組成和優異性狀遺傳規律。應用基因組學、分子遺傳學、生理生化等方法，深入研究抗病、抗逆、性別和生長等主要性狀的遺傳基礎，挖掘其決定基因及調控元件，解析其功能及調控網絡，闡明性狀形成的分子基礎；發掘有育種利用價值的優異等位基因，并應用于育種。以品質、抗病、抗逆等重要經濟性狀為目標，在重要經濟性狀遺傳解析的基礎上，集成運用家系選育、雜交、分子標記輔助選育、性別控制和基因組選擇育種等育種技術，培育優質高效的淡水養殖新品種。

　　先后主持承擔國家863計劃、國家科技支撐（攻關）、國家自然科學基金和現代農業產業技術體系等省部級以上項目70多項，獲得省部級以上科技獎勵18項，培育出荷元鯉、三雜交鯉、穎鯉、長豐鰱和長豐鯽等5個通過審定的水產養殖新品種，并在生產上廣泛推廣應用。

　　學科帶頭人：鄒桂偉研究員

　　主要骨干：梁宏偉研究員、李忠研究員、羅相忠副研究員

長豐鰱　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　長豐鰱新品種證書

長豐鯽　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　長豐鯽新品種證書