機構設置

• 管理部門

  辦公室 黨委辦公室 人事處（博士后科研工作站） 科技處（成果轉化處） 財務處 條件處

• 科研部門

  淡水魚類種質資源與生物技術研究室 漁業(yè)資源與環(huán)境研究室 水產養(yǎng)殖與遺傳育種研究室 魚類病害研究室 水產營養(yǎng)與飼料研究室 水產品檢測與質量安全研究室 水產信息與標準研究室

• 支撐部門

  荊州基地 西南漁業(yè)研究中心 梁子湖基地 長江中上游漁業(yè)生態(tài)保護研究中心

• 掛靠機構

  農業(yè)農村部淡水生物多樣性保護重點實驗室 農業(yè)農村部淡水魚類種質檢驗測試中心 農業(yè)農村部長江中上游漁業(yè)資源環(huán)境科學觀測實驗站 農業(yè)農村部水產品質量安全風險評估實驗室（武漢） 中國水產學會《淡水漁業(yè)》雜志社 全國水產標準化技術委員會淡水養(yǎng)殖分技委秘書處 農業(yè)農村部長江中上游漁業(yè)生態(tài)環(huán)境監(jiān)測中心 農業(yè)農村部中華鱘保育和增殖放流中心 中國水產科學研究院淡水魚類育種與健康養(yǎng)殖重點實驗室 湖北省水產品質量安全工程技術研究中心 國家斑點叉尾鮰加工技術研發(fā)分中心（武漢） 國家農業(yè)科學重慶觀測實驗站