長江水產研究所水產養殖與遺傳育種研究室由魚類遺傳育種、魚類生殖生理、特種水產養殖和生態養殖四個學科組組成，現有科研人員13人，其中研究員4人，副研究員1人，助理研究員8人，具有博士學位2人，碩士學位4人，在讀博士2人。

　　該研究室主要從事魚類及其他經濟、珍稀水生動物的良種選育及增養殖技術研究和健康養殖技術的推廣應用。在群體、個體、細胞和基因等層面，進行淡水經濟動物種質資源保護與保存；以魚類和經濟、瀕危水生動物為對象，開展生理學、繁殖生物學和精子及胚胎低溫生物學研究；以家系選育、細胞工程、分子標記輔助育種等技術為手段，開展優質、高產、抗逆水產優良新品種（品系）培育和育種材料創新，為淡水養殖業的可持續發展提供良種支撐。廣泛開展水產健康養殖技術的推廣應用，積極促進現代漁業的健康發展。